Wtórnym następstwem uszkodzenia kosmków jelita cienkiego w czasie zakażeniaenterotoksycznymi szczepami Escherichia coli i rotawirusem może być także niewy­dolność enzymatyczna, tj. zmniejszona ak­tywność disacharydaz (enzymów we­wnątrzkomórkowych), biorących udział w procesie trawienia disacharydów: lakto­zy — cukru zawartego w mleku, oraz innych cukrów zawartych w pożywieniu: sacharozy i maltozy, co prowadzi do ob­jawów biegunki fermentacyjnej. Ma to praktyczne znaczenie w stanach przewle­kającej się biegunki i wymaga okresowego wyłączenia z diety mleka, które jest bogate w cukier mleczny. Enteroinwazyjne bak­terie to przede wszystkim szczepy pałeczek Salmonella, Shigella, Yersinia enterocoli-ca, Klebsiella. ropy błękitnej i inne.